内分泌失调是造成女性不孕的主要原因之一，它的主要症状是不排卵。

    正常的卵巢周期中，卵子的发育及维持，主要受脑下腺及卵巢分泌的荷尔蒙所控制。而不孕的妇女，影响卵子发育的内分泌不是过多就是过少。

    在卵巢周期一半时，下视丘会刺激脑下腺分泌大量FSH及LH以便排卵，但有些人体内虽有FSH及LH，分泌量却不足以造成排卵，因此无法排卵。相对的，还有 一些人可能因脑下腺受伤或不正常，而完全不分泌或分泌过多的FSH或LH;当LH过多而FSH不足时，卵巢中会有许多滤泡发育，但却没有成熟卵，形成滤泡 囊肿。

    内分泌失调引起的问题，可用治疗内分泌失调的药物，或是提升生育力的药物如Clomiphene，hCG及hMG等来治疗。

    因内分泌失调而无法排卵的妇女，约有90%在治疗之后可正常排卵，但因某种原因，其中只有65%的妇女会受孕。

    囊肿、感染、手术所造成的疤痕，或放射线治疗造成的副作用，均有可能伤害卵巢。卵细胞的供应可能就会因而停止。在这种情况下，使用别人捐赠的卵细胞，进行人工受精是可行之道。

    除了排卵之外，内分泌还会以其它方式影响怀孕。例如，黄体激素对受精卵的存活便极为重要;如果黄体激素的分泌量不足，或分泌期过短的话，受精卵就不能生存下去，就会导致女性不孕的发生。